非洲猪瘟疫情对我国育种体系造成的打击巨大，三元母猪连自己都没想到，居然会成为非瘟时代的“流量明星”。尽管业内想尽一切办法提高三元母猪的生产性能，但先天的基因决定它终究无法媲美二元母猪，将会逐渐被行业淘汰。
三元与二元生产性能差距大
为迅速补充产能，2020年大部分猪场“见母猪就配，能早配就早配，三元杂常配”，业内各界也为提升三元母猪性能想尽了各种办法。2020年5月，山东省畜牧兽医局公开印发《三元母猪饲养管理技术指导意见》，供猪场借鉴；诸多业内专家也在剖析三元母猪留种的对策；此外，有的猪场甚至专门委托饲料厂加工三元母猪料，或者采用诱情、中药调理等措施提高受胎率。
尽管做了很多努力，但三元母猪的生产性能提升效果并不理想。湖南天心种业股份有限公司董事长万其见表示，遗传基因决定了三元母猪达到二元母猪的性能是不可能的。“我们做了一些实验，养了大概100头三元母猪，后代产了1-2胎，持续跟踪发现，产仔数并没有显著差异(小规模统计)，二元胎均11.8-12头，三元胎均11-11.5头左右。但三元母猪哺乳性能要差一些，小猪断奶重窝重差3-5公斤。一胎后配种发情率上存在明显差距，二元母猪在90%以上，而三元只有80%左右。后代生长速度没有影响，但三元母猪的后代体型整齐度差，离散度较大。”
对于市面上专门针对三元母猪的饲料，万其见认为，三元母猪饲料无非是改善泌乳性能，增加一些营养，实际上从营养角度来说没有特殊效能，也没有明显效果。
此外，湖南佳和农牧也针对三元母猪的生产性能做过测试，佳和农牧副总经理、育种总监、岳阳片区董事长唐凡告诉记者，丹系的三元猪比丹系二元猪的产仔数低2头多，一年2.4头，两胎少4.8头，也就是少产将近5头猪。其次，三元母猪发情率，受胎率和泌乳率会更差。一头三元母猪可能提供的断奶小猪比二元母猪少5头以上，甚至7、8头都有可能。
行业人士估计三元母猪将在两年内逐步淘汰
据农业农村部公布的数据，截止到2020年11月底，我国能繁母猪存栏量达到了4100万头（？？？）。从目前生猪恢复速度来看，多数业内人士认为2022年猪价将可能跌破成本线，未来肯定是养猪成本的竞争，意味着三元母猪需尽快更新，否则损耗养殖成本，影响养殖利润。
记者了解到，目前各大上市企业正在快速减少种用三元母猪的占比。正邦科技表示，公司自2019年开始逐步留种三元母猪，2020年开始，每个季度都在优化种群结构，三元母猪占比呈下降趋势，四季度将继续淘汰部分三元母猪，2021年三元母猪留种预计将逐步清空。
新希望表示，在2020年8月底的140万头父母代种猪中，公司三元母猪占比约为15%。从四季度开始，随着自主扩繁二元母猪的增加，将会逐步替代三元母猪。三元母猪虽然从整体平均水平看，与正常二元的生产效率有差异，但在其集团内部也有好坏之分。所以公司会根据其具体表现，每隔一段时间淘汰效率排名靠后的一部分三元母，对效率较高的则可以再多使用一个批次，这样来实现逐步淘汰。
回交二元母猪可快速替换三元猪
三元母猪看来只能是权宜之计，接下来，回交二元母猪将会替代三元猪，正宗二元母猪又将替代回交猪。我国种猪体系逐渐恢复正常，其实也需要时间。
唐凡表示，目前市场三元占比大约50%，扩大纯种群需要一个世代(配种到产仔需要4个月，留种母猪再到下次产仔要12个月，就是16个月)。16个月后生成二元猪，还要12个月。一个世代基本需要一年多的时间，从原种扩散下来就需要2-3个世代，也就是要两三年的功夫。所以，第二阶段就是用二元母猪回交，用回交二元猪替换三元母猪。
据唐凡介绍，从繁殖性能来看，回交二元母猪与长大二元母猪差别不大，整齐度、生长速度、屠宰率比不上二元猪。有些企业不能忍受三元猪(产仔数差)，但能忍受回交二元猪。因为没有大数据对比，回交猪二元与二元母猪整齐度、生猪速度、屠宰率的差异，所以回交二元猪可能用的时间会长一点。随着生猪产能恢复，猪价会逐渐走低，养猪利润越来越蔳，这就意味着，种猪之间一点点的性能差异，都会导致成本差距很明显。二元猪替换回交二元猪也是一种必然。
回交二元猪和三元猪是否会长期对种猪体系造成影响？湖南新五丰股份有限公司总经理刘艳书表示，影响有，但不会很大。回交是繁育体系的一种模式，不一定就是错的。有目的、有计划的回交，对性能没有产生质的变化。有着杜洛克血统的三元母猪做种猪对生产性能有一定影响，但这个时代很快会过去，也不可能持续很长时间，但是回交二元母可能会有比较长的影响，因为有些养殖集团会发展成为一种繁育方式，有的则是为了适应当前迅速扩展种猪的需求。